PDFファイルへの押印は、PDFファイルを編集するソフトウェアが必要となります。

「かんたん電子印鑑de脱ハンコ」で作成した印鑑データを、
「画像保存」で出力し、
PDFファイル編集ソフトで、画像出力した電子印鑑を配置します。